A 'supermutt' mendedahkan identiti rahsianya

Cara terbaik untuk mendapatkan anjing, secara amnya, adalah untuk menyelamatkannya. Itu selalunya bermaksud mengguna pakai mutt, kegembiraan yang terlalu banyak untuk disenaraikan. Namun banyak mutt juga datang dengan asal-usul yang malang, berpotensi menyembunyikan keperluan berkaitan baka, kebiasaan atau risiko kesihatan dalam DNA mereka.

Lima tahun yang lalu, saya menulis kira-kira dua ujian DNA anjing yang saya beli untuk mutt penyelamat saya, Otis. Hasilnya menarik dan menghiburkan, jika sedikit cahaya pada nilai praktikal. Saya membawa mereka dengan sebatian garam, tetapi saya gembira untuk mendapatkan sekurang-kurangnya sedikit pandangan.

Seperti yang saya nyatakan pada masa itu, ujian anjing-DNA komersial masih agak baru pada tahun 2012. Saya mahu akhirnya menulis tindak lanjut kepada catatan blog itu, dan kemudian permulaan berasaskan Texas yang dipanggil Embark menghubungi saya mengenai mengkaji semula yang baru ujian.

Ujian saya sebelum ini menampilkan ujian yang dijual oleh BioPet Vet dan Wisdom Panel, tetapi saya tidak menyemak semula mereka di sini. BioPet Vet tidak lagi di pasaran, dan meskipun Panel Wisdom mempunyai versi yang lebih baru, saya enggan membayar lagi untuk ujian yang mungkin sedikit berbeza daripada apa yang telah diambil oleh Otis. Dan terus terang, saya mungkin tidak pernah cuba Memulangkan lagi jika mereka tidak menghantar saya ujian percuma. Saya fikir ia adalah satu tawaran yang baik di belakang - ya, walaupun pada $ 200 - tetapi seperti yang saya akan menerangkan di bawah, ia bergantung kepada apa yang anda cari.

Mutt sukar untuk retak

Otis sebagai anak anjing. (Foto: Russell McLendon)

Pertama, biarkan saya memperkenalkan Otis secara ringkas. Kami mengamalkannya dari tempat perlindungan pada tahun 2010 sebagai "campuran serak" selama berbulan-bulan. Kami melihat sedikit sebab untuk meragui bahawa pada masa itu, kerana dia adalah anak anjing dan sudah mempunyai beberapa petunjuk huskiness seperti ekor kerinting, lebat.

Kami juga tidak begitu peduli dengan solek baka sebenar. Rasa ingin tahu kami berkembang sebagai Otis yang berumur, walaupun, sejak ini dikatakan husky tinggal cukup kecil. Memandangkan betapa banyak latihan yang diperlukan oleh husky berbanding dengan banyak baka lain, kami memutuskan untuk menggali lebih mendalam.

Saya tidak akan berpegang kepada keputusan yang terdahulu, tetapi cukup untuk mengatakan bahawa mereka tidak betul-betul sepadan. Ujian tidak melaporkan mana-mana warisan serak, dan satu-satunya baka yang disenaraikan oleh kedua-duanya adalah palang. BioPet Vet juga menyenaraikan Pekingese, beagle dan bulldog, manakala Panel Kebijaksanaan mempunyai pokok keluarga yang lebih terperinci termasuk anjing lembu Australia, chow chow dan corgi.

Kemudian, beberapa bulan yang lalu, Embark menghubungi saya di Twitter untuk bertanya sama ada saya tertarik untuk mencuba ujian mereka di Otis. Saya berkata saya, jadi mereka menghantar saya kit percuma.

Apa yang Bermula?

Otis menyingkirkan giginya ke dalam ujian DNA. (Foto: Russell McLendon)

Embark diasaskan oleh dua saudara lelaki, Ryan dan Adam Boyko, yang dibesarkan dengan anjing penyelamat. Ryan adalah saintis komputer, dan Adam adalah seorang profesor sains bioperubatan di Cornell University, di mana dia menumpukan pada kajian genom anjing. Mereka menubuhkan Embark pada tahun 2015, dan melancarkan produk pertamanya pada Mei 2016.

"Satu perkara yang kami dapati dalam penyelidikan kami adalah bahawa banyak orang mahu mempunyai anjing mereka mengambil bahagian dalam kajian, " kata Adam Boyko. "Kerana mereka fikir ia sejuk dan mereka mahu menyumbang kepada penyelidikan, tetapi juga kerana mereka ingin mengetahui tentang anjing peribadi mereka sendiri. Seperti yang kita lakukan lebih banyak, kita mula membuat sumbang saran dan membuat idea untuk melakukan canggih Ujian DNA penyelidikan untuk anjing manusia, yang sangat berbeza dengan ujian DNA sekali sahaja, dengan cara yang lebih kecil dan lebih murah, tetapi kurang komprehensif dan tidak mendorong sains ke hadapan sama sekali. "

Embark adalah produk komersil, tetapi ia timbul dari usaha saintifik: mengenal pasti penanda genetik untuk penyakit-penyakit dalam anjing, yang akhirnya boleh memberi manfaat kepada kedua-dua anjing dan kesihatan manusia. Dan oleh orang-orang yang mencari sumber dari DNA untuk melahirkan campuran baka mereka, Embark dapat memuaskan rasa ingin tahu pelanggannya sambil mengumpul data kesihatan secara beramai-ramai. Ia sama dengan model "rekreasi genomik" 23andMe, tetapi untuk anjing.

"Kami berada di dalamnya untuk menjadikan anjing lebih sihat, " kata Boyko, "dan tambahan bagus untuk itu kita dapat melihat perkara seperti keturunan."

Kisah percikan

Apa lagi dia, Otis adalah hound sofa berdarah penuh. (Foto: Russell McLendon)

Apabila kit Embark datang dalam mel, ia menggariskan proses yang biasa: Sel pipi swab - dan tidak dapat dielakkan slobber - dari mulut Otis, selamatkan swab dalam bekas, hantarnya untuk dianalisis. (Kit ini menawarkan arahan yang lebih terperinci, yang boleh anda lihat dalam video ini.) Tidak seperti ujian terdahulu, saya juga diberitahu untuk membuat akaun dalam talian.

Ia adalah beberapa minggu sebelum keputusan telah siap. Apabila mereka akhirnya tiba, saya tidak hanya menerima satu dokumen melalui surat siput atau e-mel - Saya masuk ke akaun Embark saya dan mendapati diri saya direndam dalam maklumat yang dibentangkan secara berwarna.

Dengan akaun ini, saya dapat menyemak kembali dari masa ke masa kerana penyelidikan mendedahkan pandangan baru yang berkaitan dengan Otis. Memulakan juga akan memaklumkan kepada saya apabila ciri dan hasil baru tersedia. Dan dalam masa yang sama, ada pautan awam untuk berkongsi hasil Otis. Embark menawarkan tetapan privasi yang berasingan untuk data baka, kesihatan dan sifat, tetapi saya hanya membuat semua maklumat Otis awam. (Maaf, buddy!) Anda boleh melihat profil Embark lengkapnya di sini.

Baka di antara garisan

Berikut adalah pecahan baka awal. Ia termasuk beberapa pertindihan dengan Panel Kebijaksanaan, iaitu pug, chow dan anjing lembu Australia. Peratusan tertinggi, bagaimanapun, pergi ke "supermutt, " iaitu cara Embark untuk mengakui kekaburan genetik:

Selain 'supermutt', hasil ternakan untuk Otis adalah lab, pug dan chow. (Imej: Memulakan)

"Sesetengah anjing turun dari anjing lain yang menjadi baka campuran mereka, " laman web Embark menerangkan tentang label supermutt. "Anjing-anjing lain ini boleh memberikan sumbangan kecil kepada keturunan anjing anda, jadi kecil sehingga mereka tidak lagi dapat dikenali sebagai baka tertentu."

Namun, seperti yang anda lihat di atas, terdapat petunjuk yang cukup untuk mengenal pasti tiga orang ahli bahagian supermutt: basset hound, Boston terrier dan coonhound. "Melihat ke belakang dalam tiga generasi terakhir, kita dapat melihat ia bukan nenek sulap penuh, " kata Boyko, "tetapi kami pasti melihat penanda dari baka, jadi kami meletakkannya di sana." Kebanyakan anjing hanya mempunyai peratusan kecil supermutt, tambahnya.

Menendang pokok keluarga

Seperti Panel Wisdom, Embark juga memetakan pokok keluarga dengan lebih terperinci mengenai akar supermut Otis. Ia bukan satu-satunya ibu bapa yang mungkin, tetapi Embark berkata "algoritma kami meramalkan ini adalah pokok keluarga yang paling mungkin untuk menjelaskan campuran baka Otis."

Pokok keluarga mungkin untuk Otis, hormat dari Embark. (Imej: Memulakan)

Walaupun terdapat perbezaan yang jelas, pokok keluarga ini mempunyai persamaan yang mengejutkan dengan orang itu dari Panel Kebijaksanaan. Bukan sahaja kedua-dua termasuk pug dan chow dalam keturunan Otis, misalnya, tetapi kedua-duanya mempunyai campuran pug dan campuran chow sebagai datuk nenek yang mungkin. Anjing lembu Australia juga muncul di kedua-dua, walaupun sebagai datuk penuh dalam Panel Wisdom dan hanya sebahagian daripada seorang datuk nenek di Embark.

Ia hanya boleh menjadi kuasa cadangan, tetapi saya dapat melihat petunjuk semua baka ini di Otis. Dia mempunyai ekor, batang tubuh dan selera makan poket, olahraga atletik atau petinju, dan mungkin sedikit kemerdekaan. Dan memandangkan cara dia membongkok saya di rumah pada waktu makan atau berjalan kaki, saya pasti tidak meragui anjing lembu.

Menggali DNA

Seperti yang dapat dibuktikan oleh Otis, tidak mudah untuk berhenti menggali sebaik sahaja anda bermula. (Foto: Russell McLendon)

Kunci ujian seperti Embark adalah penanda genetik, yang boleh mendedahkan asas genetik ciri warisan dari warna rambut kepada risiko kesihatan. Penyelidik menggunakan alat yang dipanggil microarray DNA untuk mencari variasi genetik di kalangan individu, termasuk polimorfisme tunggal-nukleotida (SNPs, disebut "snips").

Ujian baka awal mengandalkan hanya 30 atau 40 penanda, menjadikannya tidak berguna untuk banyak anjing, tetapi mereka telah berkembang lebih tepat akhir-akhir ini. Panel Wisdom kini hampir 2, 000 penanda, sementara Embark menggunakan lebih daripada 200, 000 berdasarkan penyelidikan sendiri. "Untuk pengetahuan saya, kami tidak menggunakan mana-mana penanda yang sama, " kata Boyko sambil menambah bahawa algoritma syarikat juga "sama sekali berbeza."

Tetapi kuantiti penanda bukan semuanya, kata Urs Giger, ketua program klinikal dalam genetik veterinar di University of Pennsylvania. Ketepatan ujian "sangat bergantung kepada berapa banyak anjing yang telah mereka uji untuk menubuhkan algoritma untuk mendapatkan jawapan yang tepat, " katanya. "Lebih-lebih lagi, apabila orang mengatakan mereka menggunakan 2, 000 atau 200, 000 SNP, persoalannya ialah berapa banyak SNP yang benar-benar bermaklumat untuk membezakan antara satu atau baka lain, ciri-ciri penyakit dan sebagainya?"

Panel Embark dan Wisdom tidak sempurna, tetapi menurut Profesor genetika klinikal Universiti Tufts, Jerold Bell, penyelidikan mereka meningkatkan mereka di atas kebanyakan pesaing AS. "Saya akan berpegang kepada kedua-dua syarikat ini kerana kebolehpercayaan mereka, " katanya, "dan keupayaan mereka untuk menjawab soalan dan menyiasat lebih lanjut mengenai soalan mengenai keputusan ujian mereka."

Sakit seperti anjing

Otis memakai kerucut malu selepas pembedahan kanser pada 2016. (Foto: Russell McLendon)

Meneroka warisan mutt seperti Otis mungkin menarik, tetapi bagi banyak doktor haiwan, ujian DNA anjing mempunyai peranan jauh lebih berharga untuk dimainkan.

"Saya fikir kesihatan haiwan lebih penting daripada membiak baka dan keturunan, " kata Giger, makmalnya telah melakukan ujian penyakit keturunan dalam anjing selama 25 tahun. Bell bersetuju, kerana mengetahui anjing mempunyai penanda genetik tertentu "boleh membenarkan langkah-langkah pencegahan yang meminimumkan atau menghilangkan berlakunya penyakit." Ujian untuk baka dan keturunan, sebaliknya, menyerangnya sebagai "lebih baru untuk pemiliknya."

Namun walaupun ketepatan yang tinggi, Giger mengatakan ujian penyakit lebih sempit dan lebih mahal sehingga baru-baru ini. "Sangat menarik untuk mendapatkan sampel cip SNP ini dianalisis, dan boleh didapati dengan cara yang agak murah untuk bukan hanya satu ujian penyakit, tetapi ujian pelbagai penyakit serta komposisi baka dan keturunan untuk harga yang sama."

Hasil kesihatan adalah titik jualan untuk Embark, dan sejak ujian lama saya tidak menyelidiki kesihatan, saya tertarik untuk melihat bahagian profil Otis itu. (Panel Kebijaksanaan 2.0 masih berbunga sahaja, tetapi versi yang lebih baru melakukan ujian untuk sejumlah kecil mutasi penyakit. Untuk lebih daripada itu, anda memerlukan ujian veterinar atau pembiak syarikat.)

Semua jelas, jenis

Seperti laporannya yang lain, bahagian kesihatan penuh dengan maklumat. Sebagai ringkasan di bawah jelas, bagaimanapun, hasil Otis adalah sebagai positif yang mungkin:

Gambaran tangkapan dari gambaran kesihatan Otis dari Embark. (Imej: Memulakan)

Mulakan sekarang ujian untuk kira-kira 160 penyakit keturunan, dan Otis diuji jelas di seluruh papan. Itu tidak biasa, Boyko menerangkan, kira-kira separuh daripada anjing yang mereka telah diuji sejauh ini mendapatkan hasil ini, dan kira-kira sepertiga adalah pembawa untuk beberapa penyakit.

Walaupun ini adalah berita gembira mengenai Otis, ia masih tidak konklusif. "Tiada anjing dan tiada siapa genetik sempurna, " kata Giger. "Setiap anjing boleh mempunyai beberapa mutasi yang merosakkan yang mungkin mengakibatkan beberapa individu mempunyai persembahan penyakit." Otis terdedah kepada tumor sel mast kanser, beberapa yang terpaksa dibuang secara surgikal dalam beberapa tahun kebelakangan. Memulakan belum mempunyai data yang mencukupi untuk mengujinya, tetapi mereka bekerja padanya - dan lebih banyak petunjuk dari anjing seperti Otis harus membantu.

"Tumor sel mast adalah kawasan penyelidikan yang aktif, " kata Boyko. "Kami telah mengumpulkan ratusan dan ratusan kes tumor sel tiang, juga mengawal, dan kami berharap melalui survei kesihatan di Embark, kami akan mendapat lebih banyak kes sel mast dengan maklumat genetik. Dan dengan saiz sampel yang lebih besar, saya fikir kami akan mula mengenal pasti itu. "

"Jadi pastikan untuk mengisi tinjauan kesihatan untuk Otis, " tambahnya. (Saya telah.) "Itu adalah salah satu sebab utama kami ingin membina Embark, kerana kami menggunakannya untuk mengenal pasti penanda untuk semua jenis perkara. Sebagai akademik, tidak ada cara yang baik untuk mendapatkan geran penyelidikan yang akan dibayar untuk menguji ribuan dan beribu-ribu anjing. "

Namun seperti ujian DNA manusia, hasil kesihatan membawa risiko salah tafsir. Mempunyai penanda untuk penyakit tidak semestinya bermaksud seekor anjing akan sakit, misalnya, dan sesetengah mutasi yang menimbulkan baka tertentu "sebenarnya boleh menyebabkan persembahan yang berbeza dalam baka lain, " kata Giger. "Mereka boleh menyebabkan penyakit dalam satu baka, dan tidak menyebabkan penyakit atau manifestasi penyakit yang lebih ringan di lain." (Oleh itu, dalam hal ini, campuran baka mutt boleh menjadi lebih daripada sekadar rasa ingin tahu.)

Untuk mengurangkan risiko kekeliruan, Embark mengelakkan memberi nasihat perubatan, menyediakan sumber dalam talian untuk meletakkan hasil dalam perspektif, dan menggalakkan pelanggan untuk berunding dengan doktor haiwan. Kaunseling genetik adalah bahagian penting dalam ujian genetik, kata Giger, walaupun kedua-dua dia dan Bell memerhatikan bahawa sesetengah doktor haiwan tidak mungkin cukup pandai untuk menawarkan bantuan itu.

Siapa takut kepada serigala kecil yang baik?

Otis menganggap menambah makanan laut untuk dietnya. (Foto: Russell McLendon)

Keputusan Otis menawarkan beberapa statistik lain yang menarik, seperti berat dewasa yang diramalkan (49 paun), umur genetik (57 tahun manusia) dan "wolfiness" (0.6 peratus):

Skor Wolfley didasarkan pada beratus-ratus penanda merentasi genom di mana anjing (atau hampir semua) adalah sama, tetapi serigala cenderung berbeza, "jelas Embark. "Penanda ini dianggap berkaitan dengan 'wabaan gen gen' di mana anjing awal dipilih untuk ciri-ciri tertentu." Kebanyakan anjing peliharaan kini mempunyai skor wolfiness sebanyak 1 peratus atau kurang, tetapi beberapa "individu yang unik" melanda 5 peratus atau lebih tinggi.

Berat yang diramalkan adalah salah satu daripada beberapa keputusan yang saya boleh menyemak fakta, dan ia adalah tempat. Itu mungkin meneka bertuah, tetapi Boyko mengatakan anggaran ini tidak selagi anda fikirkan.

"Dengan melihat ukuran badan dan faktor-faktor lain, kita sebenarnya boleh menukar usia kalendar anjing kepada usia setara manusia untuk melihat di mana kitaran hidup anjing itu, " katanya. "Dan dari pandangan ahli genetik, ada banyak yang anda boleh meramalkan dari DNA mereka, lebih banyak daripada pada orang. Ada beberapa gen yang kod untuk saiz badan, jadi kita melihat 18 gen yang berbeza dan berdasarkan itu, boleh meramalkan saiz anjing itu harus mempunyai ketepatan 80 hingga 90 peratus. Itu lebih tinggi daripada manusia. "

Mengapa saiz badan lebih mudah untuk diramal dalam anjing? "Kerana cara kita membiak anjing, " Boyko menerangkan. "Hanya beberapa gen yang memacu sebahagian besar perbezaan itu, sedangkan dengan orang, terdapat banyak variasi kecil di seluruh genom."

Namun, walaupun banyak perbezaan antara anjing dan DNA manusia, Boyko berkata data besar Embark boleh menawarkan pandangan genetik luas yang berkaitan dengan kedua-dua spesies.

"Anda mungkin mempunyai anjing yang mempunyai penanda genetik tetapi tidak pernah mengembangkan penyakit genetik, jadi terdapat mutasi yang sepadan di mana-mana genom mereka yang menghalang mereka daripada mendapat penyakit itu?" dia cakap. Selain itu, anjing juga mempunyai penyakit genetik yang lebih banyak berbanding dengan haiwan lain dan penyakit genetik yang ada pada anjing, hampir semua mempunyai manusia analog gangguan. "

Banyak untuk mengunyah

Otis mempunyai tulang untuk memilih dengan idea bahawa 'wolfiness' nya hanya 0.6 peratus. (Foto: Russell McLendon)

Saya masih belum membahas semua info Embark mendedahkan tentang Otis. Terdapat dua bahagian mengenai keturunan, contohnya, yang menggambarkan kedua-dua keturunannya dan keturunannya. Terdapat senarai mutasi untuk sifat seperti warna kot, tanda muka, panjang moncong dan penumpahan, antara lain. Terdapat peta berkod warna campuran campuran oleh kromosom. Dan seksyen profilnya juga dihuni dengan gambar anjing lain "yang mempunyai satu atau lebih banyak persamaan baka yang sama dengan Otis, " dengan pautan ke profil 'Embark anjing' itu.

Akhirnya, Boyko berkata, Embark bahkan dapat membantu menyambung semula anjing dengan sampah mereka - dengan asumsi mereka semua mempunyai profil Embark. "Sesuatu seperti pencari saudara pastinya sesuatu yang boleh anda lakukan dengan teknologi genetik, " katanya. "Itu sebenarnya sesuatu yang kami sedang berusaha, tetapi kami belum melancarkannya lagi."

Terdapat juga lebih banyak hasil kesihatan dan sifat dalam pembangunan, tambahnya, "serta perkara-perkara lain yang tidak dapat kita ramalkan kerana penyelidikan belum dilakukan."

Memulakan adalah untuk menjadi hubungan jangka panjang, mengemas kini hasil dan perkhidmatannya sepanjang masa seperti 23andMe lakukan untuk manusia. Ia berharga $ 200, yang lebih daripada ujian pengguna sebanding oleh Wisdom Panel, tetapi ia juga memberi lebih banyak terperinci sebagai balasan.

Mana-mana ujian DNA yang anda pilih, anda mengambil bahagian dalam apa yang dilihat Bell sebagai masa depan peribadi penjagaan kesihatan, kedua-dua anjing dan manusia. "Keupayaan untuk menguji gen pelbagai penyakit dalam ujian panel adalah sangat penting, " katanya, "dan kerana ujian panel itu berkembang (seperti dengan manusia), mereka akan menjadi bahagian penting dalam sejarah kesihatan dan pengurusan perubatan anjing . "

Sementara itu, Otis amat menyedihkan. Semasa saya mengupas laporan tentang penanda genetiknya untuk warna bulu dan panjang moncong, dia berdengkur dengan kuat dari sofa.

Ia agak aneh untuk mengetahui banyak tentang DNA Otis, terutama kerana dia tidak tahu DNA apa pun. Namun, saya gembira kerana semua ini dapat memberi manfaat kepada kesihatan anjing secara amnya dan kerana ia telah membantu mengingatkan saya betapa bertuah saya mengetahui makhluk aneh ini tidur di sofa saya.

Artikel Berkaitan